Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COCHO43405 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COCHO43405 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COCHO43405 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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