Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBXN8O00124 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBXN8O00124 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBXN8O00124 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms