Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms