Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms