Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms