Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA6A0AVT1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms