Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms