Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTF2Q9UNY4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms