Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIMKLBQ9ULI2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms