Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PALD1Q9ULE6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms