Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CPNE7Q9UBL6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms