Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms