Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXXC1Q9P0U4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXXC1Q9P0U4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms