Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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