Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms