Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
POLDIP3Q9BY77 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms