Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCD2Q9BXW9 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms