Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CECR2Q9BXF3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CECR2Q9BXF3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms