Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPATA16Q9BXB7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms