Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms