Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HIRIP3Q9BW71 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIRIP3Q9BW71 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms