Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 827.7 ms