Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM47Q96LD4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms