Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms