Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms