Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LTV1Q96GA3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LTV1Q96GA3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms