Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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