Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHFRQ96EP1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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