Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRN2Q92932 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRN2Q92932 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms