Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms