Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms