Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPCAT1Q8NF37 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms