Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF548Q8NEK5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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