Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLDN19Q8N6F1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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