Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PARP9Q8IXQ6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PARP9Q8IXQ6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms