Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms