Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q7L0L9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q7L0L9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms