Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms