Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z53

FRA10AC1, Protein FRA10AC1, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRA10AC1Q70Z53 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FRA10AC1Q70Z53 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms