Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM72Q6ZMU5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms