Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRN1Q6UXK5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms