Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ZNF549Q6P9A3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF549Q6P9A3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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