Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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