Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN3Q5MJ09 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms