Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TDRD12Q587J7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms