Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms