Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms