Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms