Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP6Q16828 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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