Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF4Q15306 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF4Q15306 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms